mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1 (mRNA) Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female

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Overview


Name	mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1
Unique Name	mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1
Type	mRNA
Organism	Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female (Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female)

Homology

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BLAST of mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1 vs. uniprot
Match: D7G264_ECTSI (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D7G264_ECTSI)

HSP 1 Score: 308 bits (788), Expect = 6.780e-94
Identity = 156/164 (95.12%), Postives = 159/164 (96.95%), Query Frame = 1

Query:    1 STGSRRGIGRGVGVGGDLAAKEEMARQQRRRLDSLQDSGMEVLTSVATQLGNRFFMFEGMADNFLDGVGASEQAARYRQLVERLKADAAASTVTMAPPHGANPPTWGSANPSPNPSPGRGSDYGIRPAYMLPPNGGKSWMSGIPPPAATAGPPHQQYLSRGTSE 492
            STGSR GIGRGVGVGGDLAAKEEMARQQRRRLDSLQD+GMEVLTSVATQLGNRFFMFEGMADNFLDG GASEQAARYRQLV+RLKADAAASTVTMAPPHGANPPTWGSANPSPNPSPGRG DYGIRPAY LPPNGGKSWMSGIPPPAATAGPPHQQYLSRG S+
Sbjct: 1217 STGSRTGIGRGVGVGGDLAAKEEMARQQRRRLDSLQDAGMEVLTSVATQLGNRFFMFEGMADNFLDGAGASEQAARYRQLVKRLKADAAASTVTMAPPHGANPPTWGSANPSPNPSPGRGHDYGIRPAYTLPPNGGKSWMSGIPPPAATAGPPHQQYLSRGASQ 1380

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BLAST of mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5L3P7_9PHAE (Uncharacterized protein n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCAP 1310/34 TaxID=867726 RepID=A0A6H5L3P7_9PHAE)

HSP 1 Score: 257 bits (656), Expect = 1.160e-82
Identity = 132/142 (92.96%), Postives = 136/142 (95.77%), Query Frame = 1

Query:    1 STGSRRGIGRGVGVGGDLAAKEEMARQQRRRLDSLQDSGMEVLTSVATQLGNRFFMFEGMADNFLDGVGASEQAARYRQLVERLKADAAASTVTMAPPHGANPPTWGSANPSPNPSPGRGSDYGIRPAYMLPPNGGKSWMSG 426
            STGSR GIGRGVG+  DLAA+EEMARQQRRRLDSLQD+GMEVLTSVATQLGNRFFMFEGMADNFLDG GASEQAARYRQLVERLKADAAASTVTMAPP+GANPPTWGSANPSPNPSPGRGSDYG R AYMLPPNGGKSWMSG
Sbjct:  175 STGSRPGIGRGVGMESDLAAREEMARQQRRRLDSLQDAGMEVLTSVATQLGNRFFMFEGMADNFLDGAGASEQAARYRQLVERLKADAAASTVTMAPPYGANPPTWGSANPSPNPSPGRGSDYGTRTAYMLPPNGGKSWMSG 316

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1 vs. uniprot

BLAST of mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 of Ectocarpus siliculosus 1a female vs UniRef90)
Total hits: 2


Match Name	E-value	Identity	Description
D7G264_ECTSI	6.780e-94	95.12	Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T...	[more]
A0A6H5L3P7_9PHAE	1.160e-82	92.96	Uncharacterized protein n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCA...	[more]

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
E-siliculosus-1a_F_contig11634	contig	E-siliculosus-1a_F_contig11634:246..1783 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Diamond blastx: OGS1.0 of Ectocarpus siliculosus 1a female vs UniRef90	2022-09-19
OGS1.0 of Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female	2021-02-24

Properties


Property Name	Value
Start	0
Stop	0
Cds size	513
Model size	514
Exons	3
Hectar predicted targeting category	other localisation
EggNOG OGs	COG5032@1,KOG0891@2759
EggNOG free text desc.	phosphatidylinositol kinase activity
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COG Functional cat.	BDLTU
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Preferred name	MTOR
Seed eggNOG ortholog	2880.D7G264
Seed ortholog evalue	5e-82
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Taxonomic scope	Eukaryota

Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
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The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


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1622927677.3068998-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:245..368	1622927677.3068998-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:245..368	Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female	CDS	E-siliculosus-1a_F_contig11634 246..368 +
1696318636.3863764-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:245..368	1696318636.3863764-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:245..368	Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female	CDS	E-siliculosus-1a_F_contig11634 246..368 +
1622927677.3223214-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:826..930	1622927677.3223214-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:826..930	Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female	CDS	E-siliculosus-1a_F_contig11634 827..930 +
1696318636.3998425-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:826..930	1696318636.3998425-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:826..930	Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female	CDS	E-siliculosus-1a_F_contig11634 827..930 +
1622927677.3336957-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:1497..1783	1622927677.3336957-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:1497..1783	Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female	CDS	E-siliculosus-1a_F_contig11634 1498..1783 +
1696318636.4080772-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:1497..1783	1696318636.4080772-CDS-E-siliculosus-1a_F_contig11634:1497..1783	Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female	CDS	E-siliculosus-1a_F_contig11634 1498..1783 +

Sequences

The following sequences are available for this feature:

protein sequence
mRNA from alignment at E-siliculosus-1a_F_contig11634:246..1783+
coding sequence from alignment at E-siliculosus-1a_F_contig11634:246..1783+

protein sequence of mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1

>prot_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1 ID=prot_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1|Name=mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1|organism=Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female|type=polypeptide|length=171bp
STGSRRGIGRGVGVGGDLAAKEEMARQQRRRLDSLQDSGMEVLTSVATQL
GNRFFMFEGMADNFLDGVGASEQAARYRQLVERLKADAAASTVTMAPPHG
ANPPTWGSANPSPNPSPGRGSDYGIRPAYMLPPNGGKSWMSGIPPPAATA
GPPHQQYLSRGTSEGGYGGSW

mRNA from alignment at E-siliculosus-1a_F_contig11634:246..1783+

Legend: polypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1 ID=mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1|Name=mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1|organism=Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female|type=mRNA|length=1538bp|location=Sequence derived from alignment at E-siliculosus-1a_F_contig11634:246..1783+ (Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female)
AGCACGGGTAGCCGACGTGGCATCGGGAGGGGGGTGGGCGTGGGGGGTGA
CTTGGCCGCCAAGGAGGAGATGGCGCGACAGCAACGACGTCGGCTTGACT
CTTTGCAGGACTCGGGGATGGAGGTCATACTGGCACTCTCGTTTTTTGTT
GATAGTGGTAAATAGTGGTACTGTAGTGCTGTTGTTGGTGGCGTTGTTGT
GTTGTGGTCGTTGTGGCTGTTGTGGTGGTTGTGTTGGTGGTGGTGATGGT
GATGGTGGCGTGGTTCCTGGTGTTGTTGCAGCTGTTGCTGCTGCTGCTTA
TTTTGTTGTTGCTGTTGTTCATGGCGGGGAATTGTCCTTAAGAATACGCT
CCCTCTTGGTTGTTGATGCTTGCCTAGTTGTACTTGGCACACACACCCTT
TTCCCCCTTCTTTTTTGTACGTTGAGGGTCATTGTTGTATCTTATTTTTC
CCTCCCATGTCGTTTCTTTTCCCCCGTCTGGTCCGTCCATTGTTTTGTGT
TTTTTACCTCGTGTTGCCGGCTTCCCTTCCGCCTCACGTGCTGGCAATTT
CTCTGGGCTGTCGCTTGTGCGCCTCTCACAGGTTCTCACCAGCGTAGCGA
CGCAGCTCGGTAACCGGTTCTTCATGTTCGAGGGCATGGCCGACAACTTC
CTTGACGGTGTCGGGGCCAGCGAGCAGGCGGCGAGGTATGCTACCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCCACCACACCGCGCCGAACCCCCCGGACT
GCTAACGTACCCTCCTAGGTGCCGCTCTAGACNNNNNNNNNCCCGGTTCT
TCACGTTCGGGGGCAGGGCCCACAACTTCCTTGCCGGGGCCGGGGCCCGC
GAGCAGGCGGGGGGGTATGCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCAAAGACA
TCCTGGCTGTATCACACTTGCGTTTTTTTCACTCTTTTTTGTTTCGCCCC
CCCGGGATTTTTAACGCGCTACACACTACCAACCAGACTTTATTTAAAAC
CATGAACAGCAGCGGCAGCAATCGCAGCGGCAACATCACCCAAAAAGGCA
ATACTACGTAGCAACTTTGGCAGCAGCATGCTTTGAAACCCTTAAATAGC
AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAGGCAAGTACTACTGGTA
AGAGCATCAACCAGGCAGCACAATACTCTGAACAACCATAAACGGCGACC
AAGAACAGCAACAACAACAACAATTTTTTTTTTTTTTGTGTGTGATGCAC
AGGTACCGCCAGCTAGTGGAGCGCCTCAAGGCCGACGCCGCCGCCAGCAC
GGTCACCATGGCCCCCCCCCACGGGGCCAACCCCCCCACCTGGGGCTCCG
CGAACCCCTCACCCAACCCCTCCCCGGGCCGCGGCAGCGACTACGGCATC
AGGCCCGCGTACATGCTGCCCCCCAACGGGGGCAAGAGTTGGATGTCGGG
CATACCCCCCCCTGCCGCCACCGCGGGGCCCCCTCACCAGCAGTACCTTA
GCAGGGGCACTTCTGAGGGGGGGTATGGGGGGTCGTGG

Coding sequence (CDS) from alignment at E-siliculosus-1a_F_contig11634:246..1783+

>mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1 ID=mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1|Name=mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig11634.1061.1|organism=Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female|type=CDS|length=1026bp|location=Sequence derived from alignment at E-siliculosus-1a_F_contig11634:246..1783+ (Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female)
AGCACGGGTAGCCGACGTGGCATCGGGAGGGGGGTGGGCGTGGGGGGTGA
CTTGGCCGCCAAGGAGGAGATGGCGCGACAGCAACGACGTCGGCTTGACT
CTTTGCAGGACTCGGGGATGGAGAGCACGGGTAGCCGACGTGGCATCGGG
AGGGGGGTGGGCGTGGGGGGTGACTTGGCCGCCAAGGAGGAGATGGCGCG
ACAGCAACGACGTCGGCTTGACTCTTTGCAGGACTCGGGGATGGAGGTTC
TCACCAGCGTAGCGACGCAGCTCGGTAACCGGTTCTTCATGTTCGAGGGC
ATGGCCGACAACTTCCTTGACGGTGTCGGGGCCAGCGAGCAGGCGGCGAG
GTTCTCACCAGCGTAGCGACGCAGCTCGGTAACCGGTTCTTCATGTTCGA
GGGCATGGCCGACAACTTCCTTGACGGTGTCGGGGCCAGCGAGCAGGCGG
CGAGGTACCGCCAGCTAGTGGAGCGCCTCAAGGCCGACGCCGCCGCCAGC
ACGGTCACCATGGCCCCCCCCCACGGGGCCAACCCCCCCACCTGGGGCTC
CGCGAACCCCTCACCCAACCCCTCCCCGGGCCGCGGCAGCGACTACGGCA
TCAGGCCCGCGTACATGCTGCCCCCCAACGGGGGCAAGAGTTGGATGTCG
GGCATACCCCCCCCTGCCGCCACCGCGGGGCCCCCTCACCAGCAGTACCT
TAGCAGGGGCACTTCTGAGGGGGGGTATGGGGGGTCGTGGGTACCGCCAG
CTAGTGGAGCGCCTCAAGGCCGACGCCGCCGCCAGCACGGTCACCATGGC
CCCCCCCCACGGGGCCAACCCCCCCACCTGGGGCTCCGCGAACCCCTCAC
CCAACCCCTCCCCGGGCCGCGGCAGCGACTACGGCATCAGGCCCGCGTAC
ATGCTGCCCCCCAACGGGGGCAAGAGTTGGATGTCGGGCATACCCCCCCC
TGCCGCCACCGCGGGGCCCCCTCACCAGCAGTACCTTAGCAGGGGCACTT
CTGAGGGGGGGTATGGGGGGTCGTGG