mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1 (mRNA) Ectocarpus fasciculatus EfasUO2

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Overview
NamemRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1
Unique NamemRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1
TypemRNA
OrganismEctocarpus fasciculatus EfasUO2 (Ectocarpus fasciculatus EfasUO2)
Homology
[Close]
BLAST of mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1 vs.
Match: CAP-Gly (domain-containing protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2879 RepID=A0A6H5KXT3_9PHAE)

HSP 1 Score: 139 bits (351), Expect = 1.070e-38
Identity = 70/75 (93.33%), Postives = 72/75 (96.00%), Query Frame = 1 
Query:    1 VQGTRYFTCSAGHGVFVRPDNVSPTKEGATTAAPPASASSADRRRPNPGGPELTPTQLTRRGSHASLVSENVGGS 225
            VQGTRYFTCSAGHGVFVRPDNVSPTKEGA+TAAPPASASSADRRRPNPGG E  PTQLTRRGSHASL+SENVGGS
Sbjct:   75 VQGTRYFTCSAGHGVFVRPDNVSPTKEGASTAAPPASASSADRRRPNPGGLEFAPTQLTRRGSHASLLSENVGGS 149
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1 vs.
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus EfasUO2 vs UniRef90)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
CAP-Gly1.070e-3893.33domain-containing protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID... [more]
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
E_fasciculatus_S2_contig7867contigE_fasciculatus_S2_contig7867:908..3303 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus EfasUO2 vs UniRef902022-09-19
OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus EfasUO22022-07-07
Properties
Property NameValue
Taxonomic scopeEukaryota
Stop0
Start0
Seed ortholog score149.1
Seed ortholog evalue8.5e-34
Seed eggNOG ortholog2880.D8LJ19
Preferred nameDCTN1
Model size225
KEGG koko:K04648
KEGG Pathwayko04962,ko05016,map04962,map05016
Hectar predicted targeting categoryother localisation
GOsGO:0000003,GO:0000022,GO:0000070,GO:0000086,GO:0000132,GO:0000226,GO:0000235,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000775,GO:0000776,GO:0000819,GO:0000902,GO:0000904,GO:0000922,GO:0001505,GO:0001654,GO:0001709,GO:0001738,GO:0001745,GO:0001751,GO:0001754,GO:0002009,GO:0002252,GO:0002376,GO:0002478,GO:0002495,GO:0002504,GO:0003006,GO:0003008,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005635,GO:0005694,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005814,GO:0005815,GO:0005818,GO:0005819,GO:0005828,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005868,GO:0005869,GO:0005874,GO:0005875,GO:0005876,GO:0005881,GO:0005929,GO:0005938,GO:0006403,GO:0006582,GO:0006725,GO:0006810,GO:0006836,GO:0006886,GO:0006888,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006955,GO:0006986,GO:0006996,GO:0006997,GO:0006998,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007018,GO:0007049,GO:0007051,GO:0007052,GO:0007059,GO:0007097,GO:0007098,GO:0007154,GO:0007163,GO:0007165,GO:0007267,GO:0007268,GO:0007269,GO:0007275,GO:0007338,GO:0007346,GO:0007349,GO:0007399,GO:0007409,GO:0007417,GO:0007423,GO:0007528,GO:0007610,GO:0008017,GO:0008088,GO:0008090,GO:0008092,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009566,GO:0009653,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010256,GO:0010389,GO:0010457,GO:0010564,GO:0010638,GO:0010769,GO:0010968,GO:0010970,GO:0010975,GO:0012505,GO:0015031,GO:0015629,GO:0015630,GO:0015631,GO:0015833,GO:0015931,GO:0016043,GO:0016049,GO:0016192,GO:0016197,GO:0016330,GO:0016482,GO:0018958,GO:0019725,GO:0019748,GO:0019882,GO:0019884,GO:0019886,GO:0019896,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019901,GO:0019953,GO:0021510,GO:0021517,GO:0022008,GO:0022402,GO:0022406,GO:0022411,GO:0022414,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022607,GO:0023052,GO:0023061,GO:0030010,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030154,GO:0030182,GO:0030286,GO:0030397,GO:0030424,GO:0030496,GO:0030705,GO:0030855,GO:0030859,GO:0030968,GO:0031023,GO:0031110,GO:0031112,GO:0031113,GO:0031116,GO:0031122,GO:0031175,GO:0031252,GO:0031334,GO:0031344,GO:0031616,GO:0031967,GO:0031975,GO:0032252,GO:0032253,GO:0032271,GO:0032273,GO:0032386,GO:0032388,GO:0032400,GO:0032401,GO:0032402,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032838,GO:0032879,GO:0032880,GO:0032886,GO:0032940,GO:0032989,GO:0032990,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033059,GO:0033157,GO:0033267,GO:0033365,GO:0033554,GO:0034453,GO:0034454,GO:0034501,GO:0034502,GO:0034613,GO:0034620,GO:0034643,GO:0034976,GO:0035006,GO:0035010,GO:0035011,GO:0035046,GO:0035047,GO:0035088,GO:0035089,GO:0035371,GO:0035966,GO:0035967,GO:0036477,GO:0036498,GO:0040001,GO:0040007,GO:0042051,GO:0042052,GO:0042147,GO:0042221,GO:0042440,GO:0042461,GO:0042462,GO:0042592,GO:0042802,GO:0042886,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043195,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043254,GO:0043473,GO:0043679,GO:0043933,GO:0043954,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044297,GO:0044306,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044448,GO:0044450,GO:0044456,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044770,GO:0044772,GO:0044782,GO:0044839,GO:0044877,GO:0045087,GO:0045111,GO:0045165,GO:0045184,GO:0045197,GO:0045198,GO:0045202,GO:0045505,GO:0045595,GO:0045664,GO:0046530,GO:0046903,GO:0046907,GO:0047496,GO:0047497,GO:0048002,GO:0048193,GO:0048285,GO:0048468,GO:0048489,GO:0048491,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048588,GO:0048589,GO:0048592,GO:0048646,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048675,GO:0048699,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048749,GO:0048812,GO:0048814,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048869,GO:0050657,GO:0050658,GO:0050767,GO:0050773,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050803,GO:0050807,GO:0050808,GO:0050877,GO:0050896,GO:0050905,GO:0051028,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051081,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051179,GO:0051222,GO:0051223,GO:0051225,GO:0051231,GO:0051233,GO:0051234,GO:0051236,GO:0051239,GO:0051255,GO:0051256,GO:0051276,GO:0051293,GO:0051294,GO:0051299,GO:0051383,GO:0051493,GO:0051495,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051642,GO:0051646,GO:0051647,GO:0051648,GO:0051649,GO:0051650,GO:0051653,GO:0051654,GO:0051656,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051875,GO:0051904,GO:0051905,GO:0051960,GO:0060236,GO:0060249,GO:0060271,GO:0060284,GO:0060341,GO:0060429,GO:0060560,GO:0061024,GO:0061162,GO:0061174,GO:0061176,GO:0061245,GO:0061339,GO:0061564,GO:0061670,GO:0061744,GO:0061842,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070050,GO:0070201,GO:0070507,GO:0070727,GO:0070840,GO:0070887,GO:0070925,GO:0071310,GO:0071459,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072384,GO:0072393,GO:0090063,GO:0090087,GO:0090162,GO:0090224,GO:0090307,GO:0090316,GO:0090596,GO:0097435,GO:0097458,GO:0097479,GO:0097480,GO:0097711,GO:0098687,GO:0098793,GO:0098813,GO:0098916,GO:0098930,GO:0099003,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099111,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099514,GO:0099517,GO:0099518,GO:0099519,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099558,GO:0099568,GO:0099643,GO:0099738,GO:0106027,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0120103,GO:0120111,GO:0140014,GO:0140056,GO:0150034,GO:1901360,GO:1901615,GO:1901950,GO:1901987,GO:1901990,GO:1902494,GO:1902749,GO:1902850,GO:1902903,GO:1902905,GO:1903047,GO:1903827,GO:1903829,GO:1904115,GO:1904396,GO:1904398,GO:1904951,GO:1905515,GO:1990049,GO:1990138,GO:1990535,GO:1990752,GO:2000026
Exons3
EggNOG free text desc.microtubule binding
EggNOG OGsCOG5244@1,KOG0971@2759
Ec32 ortholog descriptionCAP Gly-rich domain
Ec32 orthologEc-20_002330.1
Cds size225
COG Functional cat.D
Best tax levelEukaryota
Best eggNOG OGNA|NA|NA
BRITEko00000,ko00001,ko03036,ko04131,ko04812
Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1696842447.2977686-CDS-E_fasciculatus_S2_contig7867:907..9601696842447.2977686-CDS-E_fasciculatus_S2_contig7867:907..960Ectocarpus fasciculatus EfasUO2CDSE_fasciculatus_S2_contig7867 908..960 +
1696842447.312488-CDS-E_fasciculatus_S2_contig7867:1590..17021696842447.312488-CDS-E_fasciculatus_S2_contig7867:1590..1702Ectocarpus fasciculatus EfasUO2CDSE_fasciculatus_S2_contig7867 1591..1702 +
1696842447.3296626-CDS-E_fasciculatus_S2_contig7867:3243..33031696842447.3296626-CDS-E_fasciculatus_S2_contig7867:3243..3303Ectocarpus fasciculatus EfasUO2CDSE_fasciculatus_S2_contig7867 3244..3303 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1prot_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1Ectocarpus fasciculatus EfasUO2polypeptideE_fasciculatus_S2_contig7867 908..3303 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1

>prot_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1 ID=prot_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1|Name=mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1|organism=Ectocarpus fasciculatus EfasUO2|type=polypeptide|length=75bp
VQGTRYFTCSAGHGVFVRPDNVSPTKEGATTAAPPASASSADRRRPNPGG
PELTPTQLTRRGSHASLVSENVGGS
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mRNA from alignment at E_fasciculatus_S2_contig7867:908..3303+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1 ID=mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1|Name=mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1|organism=Ectocarpus fasciculatus EfasUO2|type=mRNA|length=2396bp|location=Sequence derived from alignment at E_fasciculatus_S2_contig7867:908..3303+ (Ectocarpus fasciculatus EfasUO2)
GTTCAGGGCACGCGGTACTTCACGTGCTCGGCGGGACACGGCGTGTTTGT
CAGGTGGGGTGATGACGAGGGTGATCGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTG
GCGATTGTGATGGTGAGATGATGCCGGTGATTTTCTGTCGGGCCGCCCGT
TTACGAACAGACGCGTGCAAGTTTGTTTCCTCCTGTGCCCTACAGAGTAC
ACGGGCAAGACGAATTGGTCGCCGAACACCTTAGCGCCTGCACGTTGCAT
GCAAGCTGGGGTTTCTCTGCCTACCCTCCTCTGCGATGTAGAAGACAGGC
ATGGCTTGTCTGTGAAGACACACAGGTGTCGCTATCCACGTAGAGCGGAT
GGCGTTTGCTGTTTTTCGTGTGCTCGGTTTGTTAATGTGTATCGACCGTG
CTACCCGGCGGACCAACGAAAAGACGTCACCGCCAGCGGGTCAAATCAAC
GTAATGTTTGAAGTACAGTTTCTAGACGCATGGTGGTCCTGTAGTTTTCT
CGGTTGTTTTTACCAAGACAGGAATAAAGTCAAGAGTTGTTTACAGGCAC
GTCCAACTTTATTGCTCCTTAACGCATACCAACCCTCGTTTGTACAAGCA
GCACTTAAATCTACATCCCTGTCGTATGTACCGGAAACTGCTCCTTCTTG
TGCATGCGGTGCGTCGCCTTGGTCGCCTCACAGGCCCGACAACGTATCCC
CCACAAAAGAAGGCGCCACGACGGCTGCACCACCGGCATCCGCTTCCTCC
GCAGATCGACGACGGCCGAACCCTGGAGGTCCAGAACTCACACCGGTAAG
GGTGGGGCTGGGGTAGTCATGTTTTGCATTCCTTAAGTGTAGTTGTCGCA
CCACGCGTCCTCGAGAGGACGGAGCATTGCTCCCCCCACAGGACCGATCA
CCGATGGCCAATCGTTCCTTCCTACTTTGCCAAAGGTGGCTCAAAAATGT
ATTTCCTGTCCTATGCTATCCTATCGCTTCCCGCCTTTTAGCGGAGGCGG
GGGGGGGATCATCGGTGTGCCGGGTGTGTTAGCCAACACGCATACTTTAT
TATAGGCAGAGACACACACAGCGCGGTGGTACGAACTAGTTTCGTTTATT
TTTGCTTTTGGGTTCTGGTTTCAAGGCGTCGCCTCCAGGCACCCCTGCCG
TGATGGACAGACATACACACACCGCAGTGGTACCACGTATTAAAAATAGT
GTGTTTGTTTCTTTTTTTTTCTGTTTTCAAGCCATCAGTCACACACAACG
TCCCTCCGGGGCACTCGTAGATACCATTTGACGAAACAGGTCTGACGGGA
TGGGATAGAAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGGGGGCTTGTGTTAG
GCTTTGCGGCTCGTGGGAATCGACGACACGACTGCAGATGCACACACCTT
AGAGAGCTGTTGTAGCGGCTCAACCGGGACGAATGTCCAAGGCGAAATAT
CTCGCGAAATGACTCGGTTGGAGGCGATGTGGGTGCAAGTTTTCGTGATC
CCAAGTCATTCCCCCGTTAGCCATTCCGACGCTGTGCCAAGGCGGTCCCG
GTTCCTCGCCCACCATGTAAATACAGTCCTGGGCCCGCTTTAGTGCCGGT
GAATTTTCTGTGAATTTTCTGGGCACATACCGGCGCTAAGCGGGCCCAGT
ACTGTGTGGCAAACGCATGGAGGTTGTAGCAAGGTGCCGTGATCGGTGGT
ACAAGTAAACCTTCTCGAATAGCCATGCATATGGAAATGGTCGACTGACG
AAGGCAAGCAACGAATTTTGGGTGCCCCCTCCCCCCATCTGGTTTGGCAC
AGCAAATGCAATAGAATGCAATAGAATGCAATAGAATGCAATAGAATGCA
ATAGAATGCAATAGAATGCAATAGAATGCAATAGAATGCAATAGAATGCA
ATAGAATGCAAAGGGTAAGGGTCATGACGAGCTTCTGGTACACATCCTTG
TGAAACTTAGTAGCCTGGGCCAGCGGCATATGTATCGCTCCATCCTGGCG
TTGCAGCGATGCGAGGTCTCTCCATGGCCTATTGACTACGGCGGCGTGCG
TTTACAAAAGTACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCGCCATCCCCC
AGAACCAAAAGAAAAAGAAAAAGCAAAAAACAACCCACACAACCCAAACC
AACCATCACAAACCCACACNNNNNNNNNNTTCAAGGAATCGGAGGTTCCT
CCCCTCCTCTTTGACCACCGGGGCGTGCTTTTAAAAAACTCCCCCCCCCC
CCCCCCCCTCCTAGTGGTCAATGGGCAAACCGCTAAGGAATGCAAATCAT
GAGTTCGCCCCCCACCCCCACCAACCTCTATTGGAAACCCAGTTGACCCG
GAGAGGCTCGCACGCCTCGCTGGTGTCGGAAAACGTTGGCGGCTCC
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Coding sequence (CDS) from alignment at E_fasciculatus_S2_contig7867:908..3303+

>mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1 ID=mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1|Name=mRNA_E_fasciculatus_S2_contig7867.16028.1|organism=Ectocarpus fasciculatus EfasUO2|type=CDS|length=225bp|location=Sequence derived from alignment at E_fasciculatus_S2_contig7867:908..3303+ (Ectocarpus fasciculatus EfasUO2)
GTTCAGGGCACGCGGTACTTCACGTGCTCGGCGGGACACGGCGTGTTTGT
CAGGCCCGACAACGTATCCCCCACAAAAGAAGGCGCCACGACGGCTGCAC
CACCGGCATCCGCTTCCTCCGCAGATCGACGACGGCCGAACCCTGGAGGT
CCAGAACTCACACCGACCCAGTTGACCCGGAGAGGCTCGCACGCCTCGCT
GGTGTCGGAAAACGTTGGCGGCTCC
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