mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 (mRNA) Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NamemRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1
Unique NamemRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1
TypemRNA
OrganismEctocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female (Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female)
Homology
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: D7G264_ECTSI (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D7G264_ECTSI)

HSP 1 Score: 417 bits (1072), Expect = 8.490e-130
Identity = 216/222 (97.30%), Postives = 219/222 (98.65%), Query Frame = 1
Query:  166 FDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDIIKEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKGDPRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQILLYLRAQRLQAEAVAAGASTSRGDISP 831
            FDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALK+GS+DIIKEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYV+KVIEILPLKG PRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRA GNT WSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQILLYLRAQRLQAEAVAAGASTSRGDISP
Sbjct:  537 FDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKYGSEDIIKEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVKKVIEILPLKGHPRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRARGNTRWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQILLYLRAQRLQAEAVAAGASTSRGDISP 758          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: A0A7S2EH81_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1 Tax=Ditylum brightwellii TaxID=49249 RepID=A0A7S2EH81_9STRA)

HSP 1 Score: 210 bits (535), Expect = 8.510e-60
Identity = 118/249 (47.39%), Postives = 160/249 (64.26%), Query Frame = 1
Query:    1 QVTEEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDII-KEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKG-DPRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRY 741
            ++ EE+L  +LRV +SD SP +R  +VR  D R+D YL + HH+  L L+L D    +R  AL LLGRLA+ NPA +L  L  VL  +++ L+ G D    +E +TR+L  FLK   L  LVHP++  +I  LPLKG  PRLA+AALEALG L+  +   + P++ +LIP ++ ++QD ++ + +  SLRTLG I   TGYVI PYL YP LL  A  +L      PW+LR EV+RT GILGALDP RY
Sbjct:  234 KLMEEVLQKLLRVAVSDPSPLVRLCVVRALDLRYDPYLCQTHHLPPLFLMLQDEALFVRAAALQLLGRLARLNPAPILPNLRRVLMDLIIELRCGGDTGGGREAATRLLVVFLKERVLHRLVHPFLPSIIGALPLKGVAPRLASAALEALGELAQVSRTSLTPWVHQLIPHILETMQDQSSASKQRTSLRTLGHIAGGTGYVISPYLDYPQLLPQAADVLPGTKRAPWALRREVIRTFGILGALDPDRY 482          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: A0A7S4MY56_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1 Tax=Odontella aurita TaxID=265563 RepID=A0A7S4MY56_9STRA)

HSP 1 Score: 212 bits (539), Expect = 2.430e-58
Identity = 118/249 (47.39%), Postives = 164/249 (65.86%), Query Frame = 1
Query:    1 QVTEEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDII-KEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKG-DPRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRY 741
            ++  E+L  +LRV +SD S  +R  +VR  D R+D YL +AH++  L LLL D    +R  AL LLGRLA+ NPA +L  L   L  +V+ L+ G D    +E +TR+L  FL+A AL  LVHP++  +IE LPL+G  PRLA+A+LEALG L+  A   + P++ +L+P ++ ++QD ++   ++ SLRTLG+I  ATGYV+ PYL YP LL  A  +L      PW+LR EV+RTLGILGALDP RY
Sbjct:  889 KLLSEVLSKLLRVAVSDPSALVRHCVVRALDDRYDHYLCQAHNLPPLFLLLQDEALTVRASALHLLGRLARLNPAPILPALRRTLIELVLELRCGGDTGGGREVATRLLIVFLRAEALHRLVHPFLPSIIEALPLRGVAPRLASASLEALGELAQVARSSLTPWVHQLVPHILETLQDQSSATKQKTSLRTLGQIAGATGYVVSPYLDYPQLLPQAADVLPGTKRAPWALRREVIRTLGILGALDPDRY 1137          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: A0A448Z8Z4_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Pseudo-nitzschia multistriata TaxID=183589 RepID=A0A448Z8Z4_9STRA)

HSP 1 Score: 200 bits (508), Expect = 3.460e-54
Identity = 108/248 (43.55%), Postives = 163/248 (65.73%), Query Frame = 1
Query:    4 VTEEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDD-IIKEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKGD-PRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRY 741
            + E +LD +L+V +SD SP +R  +VR  D+R+D +L +   +  LLLLL D     R   ++LLGRLA FNPA +L  +   L  ++V L+ G D    +E++TR+L  FL++ +L+ L+HP +  +IE LPL G  PRLA+AA+EALG L+ +A   + P++++++P ++ ++QD ++ + +  SLRTL +I  +TGYVI+PY+ YP LL  A  IL      PWSLR EV+R LG+LGALDP  Y
Sbjct:  891 IIEHVLDILLQVAVSDTSPVVRLCVVRALDSRYDPFLCQVDLIQHLLLLLQDEVLATRAAGVSLLGRLASFNPAPILPAMRKFLMEVIVELQCGVDSGRSREEATRLLVVFLRSNSLRRLIHPVLPAMIETLPLNGKTPRLASAAMEALGELAKTAGVALQPWVNEVVPIILDTLQDQSSASKQRASLRTLAQIAGSTGYVIQPYIDYPKLLSQATDILPGTKRAPWSLRREVIRMLGVLGALDPDLY 1138          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: B7G3H7_PHATC (Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Phaeodactylum tricornutum TaxID=2850 RepID=B7G3H7_PHATC)

HSP 1 Score: 199 bits (507), Expect = 4.730e-54
Identity = 113/271 (41.70%), Postives = 168/271 (61.99%), Query Frame = 1
Query:    4 VTEEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDII-KEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKG--DPRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQILLYLRAQRLQAEAVAAGAS 807
            + E++L+++LR  +SD S  +R  +VR  DTR+D +L + HH+  L L+L D     R+  L LLGRLA  NPA +L  L   L  +VV L+ G D    +E++TR+L  FL+   L+ L+HP +  ++  LPL G   PRLA+A+LEALG L+ +    + P+++ +IP ++ +++D ++ + +  SLRTLG+I  +TGYV++ YL YP LL  A  IL A    PW+LR EV+RTLGI+GALDP RY  +    R   +Q   VA   S
Sbjct:  563 IIEDVLEALLRAAVSDSSAVVRLCVVRALDTRYDPFLCQTHHLQDLFLVLQDETLATRVAGLQLLGRLASLNPAPILPVLRRFLNDLVVELQCGVDTGRGREEATRLLVVFLRVKPLQRLIHPVLATLVGALPLTGAAPPRLASASLEALGELAQATGTALQPWVNDIIPHVLNTMKDQSSASKQRTSLRTLGQIAGSTGYVVRLYLDYPNLLSQATDILPATKRAPWTLRREVIRTLGIIGALDPDRYYSVASKARKGGVQYAMVAQPVS 833          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: A0A482SYQ0_9ARCH (DUF3385 domain-containing protein n=1 Tax=archaeon TaxID=1906665 RepID=A0A482SYQ0_9ARCH)

HSP 1 Score: 195 bits (495), Expect = 1.890e-52
Identity = 109/276 (39.49%), Postives = 172/276 (62.32%), Query Frame = 1
Query:   10 EEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDIIKEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKG-DPRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSIL-RAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQILLYLRAQRLQAEAVAAGASTSRGDISP 831
            E+I++ +L V +SD S  +R  +++   + FD YL+R+HHV+T++LLL D  FDI+L+ L +LGRLA  N A +L PL   L  ++  L    D  + E++  MLC F+K     +LV P ++ ++E LPLKG D R  T+ALE +G LS+   + + P+ + L+P +IT++ D++++  +EV++RTLG+   +TG  ++PYL YP LL     +L R   + P SLR E+LRTLG+LGAL+P RY  I+ +++      +  + GA     DI P
Sbjct:  554 EDIINRLLEVAVSDTSVKVRLGVLKALTSDFDKYLARSHHVETIMLLLADEMFDIKLETLTILGRLAPKNAAAILPPLRTHLNRLMSELTNCPDYRMIEEAATMLCNFMKFTKFHFLVRPIMQTLLECLPLKGKDVRATTSALETVGELSVVLQQELTPYAETLLPVIITNMFDASSLKKQEVAVRTLGQFSKSTGLAVRPYLLYPQLLPKTLDLLCRNSVHKPLSLRLEILRTLGLLGALEPSRYAAIVSFIQTYYKSKKPNSDGAE----DIKP 825          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: A0A1E7FSN9_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Fragilariopsis cylindrus CCMP1102 TaxID=635003 RepID=A0A1E7FSN9_9STRA)

HSP 1 Score: 194 bits (494), Expect = 2.590e-52
Identity = 110/251 (43.82%), Postives = 161/251 (64.14%), Query Frame = 1
Query:    4 VTEEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDII-KEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKGD-PRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQI 750
            + E +LD +LRV +SD SP +R  +VR  D+R+D +L +A  +  LLLLL D     R   + LLGRLA  NPA +L  +   L  +VV L+ G D    +E++TR+L  FL++ +L+ LV P +  +I  LPL G  PRLA+AA+EALG L+ +A   + P++ +++P ++ ++QD ++ + +  SLRTL +I  +TGYVI+PY+ YP LL  A  IL      PWSLR EV+RTLG+LGALDP  Y  +
Sbjct:  535 IIENVLDMLLRVAVSDPSPVVRLCVVRALDSRYDPFLCQADSLQPLLLLLQDEVLATRAAGVRLLGRLASLNPAPILPFMRKFLMEVVVELQCGVDTGRGREEATRLLVVFLRSKSLQRLVRPILPAMIGTLPLNGGTPRLASAAMEALGELAKTAGAALQPWVKEIVPNILETLQDQSSASKQRASLRTLAQIAGSTGYVIQPYIDYPKLLSQATDILPGTKRAPWSLRREVIRTLGVLGALDPDLYNTV 785          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: W7TTX4_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Monodopsidaceae TaxID=425072 RepID=W7TTX4_9STRA)

HSP 1 Score: 190 bits (483), Expect = 7.720e-51
Identity = 114/295 (38.64%), Postives = 171/295 (57.97%), Query Frame = 1
Query:    1 QVTEEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDIIKE-------------------------QSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLK-GDPRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNT--PWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQILLYLRAQRLQAEAVAAG 801
            +V EE+L  +L+V ++D    +R  L+   D RFD  L +A HV ++  LL D  F +R+ A+ LLGRLA  NPAY+L P+   L  ++  +++       E                         ++T +L  FL+A AL+ L+ P++  ++  LP++ G  RL+  ALEALG L+      M PF+D+L+P  I  + D ++ + RE+++R LG++ S+TGYVIKPYL++PTLL    S+LR GG+   PWSLR E LRT G+LGALDPYR+ QI+     +R +  A A G
Sbjct:  435 EVIEEVLRRLLQVTIADPDATLRLTLLHALDRRFDPCLCQAPHVQSVFFLLRDEYFPVRVAAIHLLGRLAARNPAYVLPPMRLALARLLTDVQYDGPPRANEGGKGGXXXXXXXXXXXXXXXXGRAEEATVLLGHFLRAEALQRLIRPFIPTMVRALPIQHGSTRLSAVALEALGELASVVKADMAPFLDQLLPLTIEHLNDQSSAHKREMAMRALGQLASSTGYVIKPYLQHPTLLPKILSVLREGGSNAMPWSLRREALRTFGVLGALDPYRF-QII----QERARLTAAAGG 724          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: K0SSS6_THAOC (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Thalassiosira oceanica TaxID=159749 RepID=K0SSS6_THAOC)

HSP 1 Score: 189 bits (481), Expect = 1.430e-50
Identity = 106/247 (42.91%), Postives = 156/247 (63.16%), Query Frame = 1
Query:    7 TEEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDIIKEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKGDPRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQ 747
            TE+IL  +LR+ ++D SP +R  +V+  D R+D YLS+   +  L L+L D    +R  AL +LGRL++ NPA +L  L  VL  ++V L+ G D+  +E +TR++  FL+  AL+ L  P++  +++ LPL+G PRL +A+ EALG L+  A   + P++ +LIP ++ ++QD  N + + VSL  LGRI   TGYV+ PYL YP +L     IL       W LR EVLRT G+LGALDP R+GQ
Sbjct:  757 TEDILQKLLRLAVADQSPIVRLCIVQGLDARYDPYLSQLFLLSPLFLMLEDEALAVRACALQILGRLSRLNPAAILPGLRQVLCDLIVELQCGGDNA-EEVATRLIILFLREEALQRLTRPFISAIVDSLPLEGAPRLVSASFEALGELANVAHNTISPWLRQLIPLILENVQDQ-NGSKKRVSLWALGRIAYGTGYVVTPYLDYPEMLGRLSEILPTTKKAIWELRREVLRTFGVLGALDPDRFGQ 1001          
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Match: A0A7S2P9Q5_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1 Tax=Skeletonema marinoi TaxID=267567 RepID=A0A7S2P9Q5_9STRA)

HSP 1 Score: 188 bits (477), Expect = 4.840e-50
Identity = 110/246 (44.72%), Postives = 155/246 (63.01%), Query Frame = 1
Query:   10 EEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLLLGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDIIKEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKGD-PRLATAALEALGWLSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYVIKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYG 744
            EEIL  +LR+ +SD+SP +R  +V   D R+D YLS+   +  L L+L D    +R  AL LLGRL++ NPA +L  L  VL  +++ L+ G D   KE +TRM+  FL+  AL+ LV P++  +I+ LPL  D PRL +A+LEALG L+  A   + P++ +LIP ++ +++D  N + ++VSL  LG+I   T YVI PYL YP LL  A +IL       W LR EV RT G+LGALDP R+G
Sbjct:  530 EEILQKLLRISVSDLSPVVRLCVVSGLDERYDPYLSQLSLLPPLFLMLEDETLVMRACALQLLGRLSRLNPATILPGLRIVLTDLILELQCGGDGGGKEAATRMIIVFLREEALQQLVRPFISSIIDSLPLSDDVPRLVSASLEALGELADVAHGSIKPWLRQLIPHILNNVEDQ-NSSKQKVSLWALGKIAFGTNYVISPYLDYPKLLSQASNILPTTKRASWELRREVFRTFGVLGALDPDRFG 774          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female vs UniRef90)
Total hits: 25
Match NameE-valueIdentityDescription
D7G264_ECTSI8.490e-13097.30Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T... [more]
A0A7S2EH81_9STRA8.510e-6047.39Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1... [more]
A0A7S4MY56_9STRA2.430e-5847.39Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1... [more]
A0A448Z8Z4_9STRA3.460e-5443.55Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Pseudo... [more]
B7G3H7_PHATC4.730e-5441.70Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Phaeod... [more]
A0A482SYQ0_9ARCH1.890e-5239.49DUF3385 domain-containing protein n=1 Tax=archaeon... [more]
A0A1E7FSN9_9STRA2.590e-5243.82Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Fragil... [more]
W7TTX4_9STRA7.720e-5138.64Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Monodo... [more]
K0SSS6_THAOC1.430e-5042.91Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Thalas... [more]
A0A7S2P9Q5_9STRA4.840e-5044.72Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1... [more]

Pages

back to top
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
E-fasciculatus_F_contig13258contigE-fasciculatus_F_contig13258:576..3673 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female vs UniRef902022-09-19
OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female2021-02-24
Properties
Property NameValue
Taxonomic scopeEukaryota
Seed ortholog score417.2
Seed ortholog evalue6.7e-114
Seed eggNOG ortholog2880.D7G264
Preferred nameMTOR
KEGG koko:K07203
KEGG Pathwayko01521,ko01522,ko04012,ko04066,ko04072,ko04136,ko04138,ko04139,ko04140,ko04150,ko04151,ko04152,ko04211,ko04212,ko04213,ko04218,ko04371,ko04630,ko04659,ko04714,ko04910,ko04919,ko04920,ko04930,ko04931,ko05165,ko05167,ko05200,ko05205,ko05206,ko05210,ko05212,ko05214,ko05215,ko05221,ko05224,ko05225,ko05226,ko05230,ko05231,map01521,map01522,map04012,map04066,map04072,map04136,map04138,map04139,map04140,map04150,map04151,map04152,map04211,map04212,map04213,map04218,map04371,map04630,map04659,map04714,map04910,map04919,map04920,map04930,map04931,map05165,map05167,map05200,map05205,map05206,map05210,map05212,map05214,map05215,map05221,map05224,map05225,map05226,map05230,map05231
GOsGO:0000003,GO:0000139,GO:0000182,GO:0000228,GO:0000322,GO:0000323,GO:0000324,GO:0000329,GO:0000491,GO:0000492,GO:0000768,GO:0000785,GO:0000790,GO:0000902,GO:0000904,GO:0000981,GO:0001016,GO:0001025,GO:0001030,GO:0001031,GO:0001032,GO:0001067,GO:0001101,GO:0001156,GO:0001300,GO:0001505,GO:0001558,GO:0001666,GO:0001763,GO:0001775,GO:0001932,GO:0001933,GO:0001934,GO:0001936,GO:0001938,GO:0002009,GO:0002119,GO:0002164,GO:0002165,GO:0002250,GO:0002252,GO:0002263,GO:0002285,GO:0002286,GO:0002287,GO:0002292,GO:0002293,GO:0002294,GO:0002295,GO:0002296,GO:0002360,GO:0002363,GO:0002366,GO:0002376,GO:0002460,GO:0002520,GO:0002521,GO:0002682,GO:0002683,GO:0002697,GO:0002698,GO:0002761,GO:0002831,GO:0002832,GO:0003006,GO:0003007,GO:0003008,GO:0003012,GO:0003013,GO:0003015,GO:0003170,GO:0003179,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005694,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005764,GO:0005768,GO:0005773,GO:0005774,GO:0005794,GO:0005829,GO:0005844,GO:0005886,GO:0005979,GO:0006091,GO:0006109,GO:0006112,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006207,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006356,GO:0006357,GO:0006359,GO:0006360,GO:0006412,GO:0006413,GO:0006417,GO:0006446,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006518,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006661,GO:0006725,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006914,GO:0006915,GO:0006936,GO:0006941,GO:0006949,GO:0006950,GO:0006955,GO:0006970,GO:0006974,GO:0006979,GO:0006995,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007015,GO:0007049,GO:0007050,GO:0007154,GO:0007163,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007167,GO:0007169,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007282,GO:0007292,GO:0007293,GO:0007346,GO:0007399,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007424,GO:0007430,GO:0007492,GO:0007498,GO:0007507,GO:0007520,GO:0007525,GO:0007548,GO:0007552,GO:0007565,GO:0007568,GO:0007569,GO:0007584,GO:0007610,GO:0007611,GO:0007612,GO:0007613,GO:0007616,GO:0007632,GO:0008015,GO:0008064,GO:0008104,GO:0008134,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008283,GO:0008284,GO:0008286,GO:0008306,GO:0008340,GO:0008356,GO:0008361,GO:0008406,GO:0008542,GO:0008582,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009112,GO:0009266,GO:0009267,GO:0009303,GO:0009314,GO:0009408,GO:0009410,GO:0009416,GO:0009605,GO:0009606,GO:0009607,GO:0009611,GO:0009615,GO:0009628,GO:0009629,GO:0009630,GO:0009635,GO:0009636,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009733,GO:0009743,GO:0009744,GO:0009745,GO:0009756,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009793,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009895,GO:0009896,GO:0009898,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010008,GO:0010033,GO:0010035,GO:0010115,GO:0010116,GO:0010154,GO:0010182,GO:0010243,GO:0010259,GO:0010389,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010506,GO:0010507,GO:0010514,GO:0010515,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010562,GO:0010563,GO:0010564,GO:0010565,GO:0010591,GO:0010592,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010611,GO:0010613,GO:0010623,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010632,GO:0010634,GO:0010638,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010675,GO:0010717,GO:0010718,GO:0010720,GO:0010769,GO:0010770,GO:0010830,GO:0010831,GO:0010906,GO:0010921,GO:0010922,GO:0010928,GO:0010929,GO:0010941,GO:0010942,GO:0010948,GO:0010962,GO:0010971,GO:0010972,GO:0010975,GO:0010976,GO:0012501,GO:0012505,GO:0014013,GO:0014015,GO:0014041,GO:0014042,GO:0014070,GO:0014072,GO:0014706,GO:0014733,GO:0014735,GO:0014736,GO:0014742,GO:0014743,GO:0014744,GO:0014745,GO:0014823,GO:0014902,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016192,GO:0016197,GO:0016202,GO:0016226,GO:0016241,GO:0016242,GO:0016301,GO:0016303,GO:0016310,GO:0016358,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017085,GO:0018105,GO:0018107,GO:0018130,GO:0018193,GO:0018209,GO:0018210,GO:0019216,GO:0019217,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019221,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019747,GO:0019856,GO:0019897,GO:0019898,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019901,GO:0019904,GO:0019953,GO:0021510,GO:0022008,GO:0022402,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030029,GO:0030030,GO:0030036,GO:0030037,GO:0030097,GO:0030098,GO:0030100,GO:0030154,GO:0030162,GO:0030163,GO:0030182,GO:0030217,GO:0030258,GO:0030307,GO:0030334,GO:0030335,GO:0030425,GO:0030727,GO:0030832,GO:0030833,GO:0030838,GO:0030950,GO:0030952,GO:0031090,GO:0031135,GO:0031136,GO:0031137,GO:0031138,GO:0031139,GO:0031140,GO:0031142,GO:0031156,GO:0031163,GO:0031175,GO:0031234,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031330,GO:0031331,GO:0031334,GO:0031344,GO:0031346,GO:0031347,GO:0031348,GO:0031396,GO:0031397,GO:0031399,GO:0031400,GO:0031401,GO:0031410,GO:0031505,GO:0031529,GO:0031532,GO:0031641,GO:0031644,GO:0031646,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0031670,GO:0031929,GO:0031930,GO:0031931,GO:0031932,GO:0031974,GO:0031981,GO:0031982,GO:0031984,GO:0031998,GO:0032092,GO:0032095,GO:0032101,GO:0032102,GO:0032103,GO:0032104,GO:0032107,GO:0032147,GO:0032148,GO:0032231,GO:0032233,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0032271,GO:0032273,GO:0032434,GO:0032436,GO:0032456,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032516,GO:0032535,GO:0032774,GO:0032868,GO:0032869,GO:0032870,GO:0032879,GO:0032881,GO:0032885,GO:0032956,GO:0032970,GO:0032989,GO:0032990,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033554,GO:0033674,GO:0034064,GO:0034097,GO:0034198,GO:0034248,GO:0034250,GO:0034285,GO:0034599,GO:0034605,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0034660,GO:0034762,GO:0034763,GO:0034765,GO:0034766,GO:0035004,GO:0035023,GO:0035025,GO:0035051,GO:0035069,GO:0035096,GO:0035176,GO:0035239,GO:0035262,GO:0035264,GO:0035295,GO:0035303,GO:0035304,GO:0035306,GO:0035307,GO:0035556,GO:0035710,GO:0035722,GO:0036092,GO:0036211,GO:0036293,GO:0036294,GO:0036477,GO:0038201,GO:0038202,GO:0038203,GO:0040007,GO:0040008,GO:0040012,GO:0040014,GO:0040017,GO:0040018,GO:0040019,GO:0042060,GO:0042088,GO:0042093,GO:0042110,GO:0042127,GO:0042149,GO:0042176,GO:0042177,GO:0042220,GO:0042221,GO:0042254,GO:0042325,GO:0042326,GO:0042327,GO:0042493,GO:0042594,GO:0042692,GO:0042790,GO:0042802,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043043,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043087,GO:0043170,GO:0043200,GO:0043201,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043254,GO:0043255,GO:0043269,GO:0043271,GO:0043276,GO:0043278,GO:0043279,GO:0043367,GO:0043368,GO:0043369,GO:0043373,GO:0043393,GO:0043412,GO:0043434,GO:0043455,GO:0043467,GO:0043487,GO:0043488,GO:0043489,GO:0043502,GO:0043549,GO:0043562,GO:0043565,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043610,GO:0043621,GO:0043666,GO:0043900,GO:0043901,GO:0043902,GO:0043933,GO:0044057,GO:0044070,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044093,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044431,GO:0044433,GO:0044437,GO:0044440,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044454,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044571,GO:0044703,GO:0044706,GO:0044877,GO:0045017,GO:0045058,GO:0045063,GO:0045137,GO:0045165,GO:0045176,GO:0045229,GO:0045321,GO:0045428,GO:0045429,GO:0045472,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045598,GO:0045637,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045670,GO:0045685,GO:0045687,GO:0045727,GO:0045732,GO:0045786,GO:0045787,GO:0045792,GO:0045793,GO:0045807,GO:0045828,GO:0045834,GO:0045844,GO:0045859,GO:0045860,GO:0045861,GO:0045862,GO:0045887,GO:0045893,GO:0045927,GO:0045930,GO:0045931,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045936,GO:0045937,GO:0045943,GO:0045945,GO:0045948,GO:0045995,GO:0046112,GO:0046320,GO:0046474,GO:0046483,GO:0046486,GO:0046488,GO:0046578,GO:0046579,GO:0046620,GO:0046622,GO:0046626,GO:0046628,GO:0046631,GO:0046632,GO:0046649,GO:0046677,GO:0046685,GO:0046777,GO:0046834,GO:0046854,GO:0046889,GO:0046890,GO:0046907,GO:0046999,GO:0048134,GO:0048135,GO:0048142,GO:0048255,GO:0048316,GO:0048382,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048477,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048520,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048534,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048589,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048634,GO:0048636,GO:0048638,GO:0048639,GO:0048646,GO:0048660,GO:0048661,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048707,GO:0048713,GO:0048714,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048738,GO:0048754,GO:0048812,GO:0048813,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048869,GO:0050678,GO:0050679,GO:0050687,GO:0050688,GO:0050730,GO:0050731,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050772,GO:0050773,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050795,GO:0050803,GO:0050807,GO:0050848,GO:0050849,GO:0050877,GO:0050879,GO:0050881,GO:0050882,GO:0050890,GO:0050896,GO:0050920,GO:0050921,GO:0050994,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051051,GO:0051056,GO:0051057,GO:0051094,GO:0051098,GO:0051099,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051146,GO:0051147,GO:0051149,GO:0051153,GO:0051155,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051186,GO:0051219,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051270,GO:0051272,GO:0051301,GO:0051321,GO:0051336,GO:0051338,GO:0051345,GO:0051347,GO:0051492,GO:0051493,GO:0051495,GO:0051496,GO:0051547,GO:0051549,GO:0051604,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051705,GO:0051707,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051896,GO:0051897,GO:0051930,GO:0051931,GO:0051960,GO:0051962,GO:0051963,GO:0051965,GO:0052742,GO:0055001,GO:0055002,GO:0055006,GO:0055007,GO:0055013,GO:0055021,GO:0055023,GO:0055024,GO:0055025,GO:0055086,GO:0055114,GO:0060033,GO:0060047,GO:0060048,GO:0060135,GO:0060251,GO:0060252,GO:0060255,GO:0060259,GO:0060284,GO:0060322,GO:0060359,GO:0060420,GO:0060421,GO:0060429,GO:0060446,GO:0060491,GO:0060537,GO:0060541,GO:0060548,GO:0060562,GO:0060627,GO:0060998,GO:0060999,GO:0061013,GO:0061041,GO:0061050,GO:0061051,GO:0061061,GO:0061136,GO:0061138,GO:0061458,GO:0061919,GO:0062012,GO:0062013,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070482,GO:0070671,GO:0070873,GO:0070884,GO:0070885,GO:0070887,GO:0071214,GO:0071229,GO:0071230,GO:0071233,GO:0071310,GO:0071322,GO:0071324,GO:0071329,GO:0071345,GO:0071349,GO:0071375,GO:0071417,GO:0071453,GO:0071456,GO:0071470,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071849,GO:0071850,GO:0071851,GO:0071852,GO:0071944,GO:0072347,GO:0072359,GO:0072527,GO:0072528,GO:0080084,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090066,GO:0090068,GO:0090069,GO:0090070,GO:0090153,GO:0090257,GO:0090303,GO:0090304,GO:0090335,GO:0090407,GO:0090527,GO:0090559,GO:0097159,GO:0097305,GO:0097327,GO:0097428,GO:0097435,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097659,GO:0097708,GO:0098552,GO:0098562,GO:0098588,GO:0098781,GO:0098791,GO:0098805,GO:0098852,GO:0099174,GO:0104004,GO:0106056,GO:0106057,GO:0110020,GO:0110053,GO:0120025,GO:0120032,GO:0120034,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0140096,GO:0140110,GO:1900006,GO:1900034,GO:1900076,GO:1900078,GO:1900087,GO:1900457,GO:1900459,GO:1901214,GO:1901216,GO:1901355,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901654,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901799,GO:1901800,GO:1901836,GO:1901838,GO:1901861,GO:1901863,GO:1901987,GO:1901988,GO:1901989,GO:1901990,GO:1901991,GO:1901992,GO:1902074,GO:1902105,GO:1902369,GO:1902373,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902533,GO:1902659,GO:1902661,GO:1902667,GO:1902669,GO:1902680,GO:1902743,GO:1902745,GO:1902749,GO:1902750,GO:1902751,GO:1902806,GO:1902808,GO:1902903,GO:1902905,GO:1902930,GO:1902932,GO:1903034,GO:1903036,GO:1903050,GO:1903051,GO:1903052,GO:1903311,GO:1903312,GO:1903320,GO:1903321,GO:1903362,GO:1903363,GO:1903364,GO:1903426,GO:1903428,GO:1903429,GO:1903431,GO:1903506,GO:1903508,GO:1903664,GO:1903689,GO:1903691,GO:1903706,GO:1903792,GO:1903795,GO:1903796,GO:1903935,GO:1903959,GO:1903960,GO:1903998,GO:1904000,GO:1904035,GO:1904036,GO:1904054,GO:1904056,GO:1904058,GO:1904192,GO:1904193,GO:1904195,GO:1904197,GO:1904201,GO:1904202,GO:1904204,GO:1904206,GO:1904212,GO:1904213,GO:1904396,GO:1904398,GO:1904407,GO:1904424,GO:1904426,GO:1904475,GO:1904477,GO:1904688,GO:1904690,GO:1905038,GO:1905097,GO:1905099,GO:1905207,GO:1905209,GO:1905330,GO:1905332,GO:1905356,GO:1990253,GO:1990837,GO:1990904,GO:1990928,GO:2000026,GO:2000045,GO:2000058,GO:2000060,GO:2000112,GO:2000145,GO:2000147,GO:2000232,GO:2000234,GO:2000241,GO:2000242,GO:2000243,GO:2000253,GO:2000331,GO:2000377,GO:2000379,GO:2000725,GO:2000727,GO:2000765,GO:2000767,GO:2001023,GO:2001106,GO:2001108,GO:2001141
EggNOG free text desc.phosphatidylinositol kinase activity
EggNOG OGsCOG5032@1,KOG0891@2759
EC2.7.11.1
COG Functional cat.BDLTU
BiGG ReactioniMM904.YKL203C,iND750.YKL203C
Best tax levelEukaryota
Best eggNOG OGNA|NA|NA
BRITEko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko04131
Hectar predicted targeting categoryother localisation
Exons5
Model size908
Cds size906
Stop0
Start0
Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1prot_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femalepolypeptideE-fasciculatus_F_contig13258 578..3673 -


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1622927829.119533-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:577..6481622927829.119533-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:577..648Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 578..648 -
1695995712.4075115-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:577..6481695995712.4075115-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:577..648Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 578..648 -
1622927829.132047-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:1406..16891622927829.132047-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:1406..1689Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 1407..1689 -
1695995712.4201975-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:1406..16891695995712.4201975-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:1406..1689Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 1407..1689 -
1622927829.1451097-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:2207..23541622927829.1451097-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:2207..2354Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 2208..2354 -
1695995712.429123-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:2207..23541695995712.429123-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:2207..2354Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 2208..2354 -
1622927829.1563962-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:2672..29421622927829.1563962-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:2672..2942Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 2673..2942 -
1695995712.4424524-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:2672..29421695995712.4424524-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:2672..2942Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 2673..2942 -
1622927829.1692698-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:3538..36731622927829.1692698-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:3538..3673Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 3539..3673 -
1695995712.4544966-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:3538..36731695995712.4544966-CDS-E-fasciculatus_F_contig13258:3538..3673Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13258 3539..3673 -


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1

>prot_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 ID=prot_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1|Name=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1|organism=Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female|type=polypeptide|length=302bp
QVTEEILDSVLRVCLSDVSPNIRQALVRFFDTRFDVYLSRAHHVDTLLLL
LGDMEFDIRLDALALLGRLAQFNPAYLLAPLSNVLKHIVVALKFGSDDII
KEQSTRMLCTFLKAPALKYLVHPYVRKVIEILPLKGDPRLATAALEALGW
LSLSASELMLPFMDKLIPFMITSIQDSTNVNGREVSLRTLGRIVSATGYV
IKPYLRYPTLLDSAFSILRAGGNTPWSLRCEVLRTLGILGALDPYRYGQI
LLYLRAQRLQAEAVAAGASTSRGDISPSASGNAAGGDGDGLAAAAAARHR
GK
back to top

mRNA from alignment at E-fasciculatus_F_contig13258:576..3673-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 ID=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1|Name=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1|organism=Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female|type=mRNA|length=3098bp|location=Sequence derived from alignment at E-fasciculatus_F_contig13258:576..3673- (Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female)
CAGGTGACGGAAGAGATCCTGGACAGCGTGCTGAGGGTGTGTCTGTCGGA CGTCTCGCCCAACATCCGGCAGGCCTTGGTCCGCTTCTTCGACACCCGCT TCGACGTCTACCTCTCTCGTGCACACCACGTCGACGTGAGTCTAGCGTTA GGATGTGCTGGCTGTTGTTATAGATTAGCTTGCCTGTCGATGAGTCTCGT CAGCGCAACGGTGAGGTGAGTTTAGTGTGGTGTGGGCTGTATGTCGTCTG CCGCTTTGTGCTCTACGATGTGTCATCTGCGATGCCTCAATAACGTGTGA TGGAGTAGTTTGCGACCGATTTATTGGCGGGGGCGTGTCCATTTTGCTGG GGGGTTTTCCATACCGAACCTCTCCTATAGCCAAATGTATTTTGAACTCA GAAAGAACAGTGTTCGGTGCCTCTATCTTGCGCTGCTGTACGAGGGAAGG GAAGGGAAGATAGTGCTGCACTATTCTATTCTCGCATTAATAATCGAAGG AAAGAAGGCAAAGCACCGCAAGAGGGGTGGGTAGGGGGAGAACCTCAGGG AGAAGAACCCTTCTCTGTAACCACGGGTTGGAAAACGGCACAAACGCTGT TATTTTGCGCTGATTTGAAGTGAAGACAAGAAAACAAAAATGTACGATGA CTGGGAGCTGTACACTCGCGCCCACCCCCTGGCTACCCGACAACGACCAC GAGCCCCCCCCCCAATGTCCCATTTTTTCAGACGCTACTCCTTCTCCTGG GAGACATGGAGTTCGACATACGCCTAGACGCCTTGGCGTTACTGGGAAGG CTGGCCCAGTTCAACCCCGCCTACCTGTTGGCCCCCCTGAGCAACGTGCT CAAGCATATCGTCGTTGCCCTGAAGTTCGGGAGTGACGACATAATCAAGG AGCAGTCGACGCGCATGCTGTGCACCTTCCTGAAGGCTCCGGCGCTCAAG TACTTGGTACACCCGTACGTTAGGAAGGTCATCGAGATCTTGCCGCTTAA GGTGAGAGAACGCCAAGCTTGGTAGTTGTACAATAGCGTTTTTTTTTGTT TTATGATCTTCTTCTTGCTATCGTATACGACACAAGACAACACACCCCTG GACCGATTTTCAAAAGCTTCGATTTCTTTAACGCCAAGCTTGGCTTGGTG ATTTTTTTTTTTTTTTCCTTGTGCAGTGGGCTCCTCGTGTGTGTGCAAGC ACGCTTTGCACCCCCCCACCCCCATGACATCACGGCACCCCTTTGATATA TATCATCAACCCTGCTGCCCATCCCTCACTCAACGCCTGTCGATGGATCG ATCCATCCATCCATGTCAGGGGGACCCGCGGCTGGCAACGGCAGCCCTGG AGGCCCTAGGGTGGCTGAGCCTGAGCGCGTCGGAGCTGATGCTGCCGTTC ATGGACAAGCTCATCCCCTTCATGATCACCAGCATACAGGACTCTACCAA CGTCAACGGTCGAGAGGTGGGGGTCGAGGATGCGTGCGTGTGTCTTTCGT ATTAGCATCGTGTGCGTGTCTCCCATTTTTTTCATCGACCGCGCTAACCG GCTGACCAATGAAAAGACGTCAGTCTCAGTGCGGTTGAAAACACAAAACA CCTTGTAAATGCCTTCAATGAACTGGGATCCCGTGAGGGGGCAGCATGGA GGAGGCTAAGCTATTCTCCCGATTAAAGACGGAAACGGTGGCAACGGTGG CAACAGAAGAAAACTGCGCGTGTCTACCAATGCTACTACCTTACGCGTGA GAGTGTGTGCGCGTGGCAACACTATTTGCATGCCGTTCACGTCGTCTACT GACCCCGATCACCAGTGGAGGCCGCACCGATGGATCTCTCTCTCCCTCTA TATATCTAATCCCCCTGGCGTATCGCTCCGCCCCGGCATTGTGGGGATGC GAGGTCATGGTCTAACCGCTAACGCATGCAAAACATAAGAGTACGCCCCC CCCCACCCACCCCTCCCCTACCCCCGCCCCGCAGGTCAGCCTCCGCACGC TCGGGCGCATCGTGAGCGCCACCGGCTACGTGATCAAGCCCTACCTCCGC TACCCTACCCTCCTGGACAGCGCCTTCTCCATCCTCCGGGCGGGGGGCAA CACGCCCTGGTCCCTCCGCTGCGAGGTGCTCCGGACCCTGGGCATCCTAG GGGCTCTGGACCCGTACCGTTACGGGCAGATCTTGCTCTACCTTCGGGCG CAACGGCTGCAGGCGGAGGCTGTGGCGGCGGGGGCGAGTACGAGCAGGGG GGACATAAGCCCGTCAGGTAGGTTGTCTGGTGGTGGTGGGGGTACTCATA GTCGTGCATGCCGTCGTCGGTTGACCATTGACCTCGCATCCCTACGACGG AGCATTGCCGGGTTCTCACGGGACCGGTGGCTCTCACATCACACAATCGC AAAGCGCCGTAAGGTGTTCGGCGAGTCGCGTGCTGGGTGCGCTGCATCCT GCTAAGGGTGTTCGGCATCTTGTGCGTACTTCCTTGCAACAGATGACAGC CGCGGTAGGGGGGGGGGGGTGCTGCCGTTTTTGTTTCCGATGATGATGTC GTTGATTTTGCTGTCGTCCCGTAGTTGCTGCTGCTGTATTGGATGCAGTT ACTTTGCTGTTGCTGTGTTTATTGTTGTCTTCAGTACAAGTTTCATTGTT CGTTGCTACGGGCAAGATAACACACGACGCTTGACCTGTCTCTTAGAGAC GCCCCGTGGATCGGACTACAATATAGCGGGAGGGGTAGTATCATCGTCAG CAGGGCCTCCCAATGCAGCCCTACAGACTCAAGCCTCCCTCTAACTCACT TATTTTCTCTCTCTTCGCTCTCGTTCTCTCTCTCCCTGTCTCTCTTTCTC TCCCTCTGTCTCCTCCCTCTCTCTCACCCTGTCTCTCCCTCTCTATCTCT CCTCTTTTCTACCTCTCTCTGTCTATTCTGCACCTATCTTTTCCTCTATC TTCCTCTATCTCTCTCTCCCTCTCTTACCTCTTTATCTCCCTCCCTCCCT CCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCAGCTAGTGGCAATGCCGCCGGAGGAGA CGGAGATGGTCTCGCCGCCGCAGCCGCCGCCAGGCATAGAGGAAAAGC
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at E-fasciculatus_F_contig13258:576..3673-

>mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1 ID=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1|Name=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13258.2453.1|organism=Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female|type=CDS|length=1812bp|location=Sequence derived from alignment at E-fasciculatus_F_contig13258:576..3673- (Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female)
CAGGTGACGGAAGAGATCCTGGACAGCGTGCTGAGGGTGTGTCTGTCGGA
CGTCTCGCCCAACATCCGGCAGGCCTTGGTCCGCTTCTTCGACACCCGCT
TCGACGTCTACCTCTCTCGTGCACACCACGTCGACCAGGTGACGGAAGAG
ATCCTGGACAGCGTGCTGAGGGTGTGTCTGTCGGACGTCTCGCCCAACAT
CCGGCAGGCCTTGGTCCGCTTCTTCGACACCCGCTTCGACGTCTACCTCT
CTCGTGCACACCACGTCGACACGCTACTCCTTCTCCTGGGAGACATGGAG
TTCGACATACGCCTAGACGCCTTGGCGTTACTGGGAAGGCTGGCCCAGTT
CAACCCCGCCTACCTGTTGGCCCCCCTGAGCAACGTGCTCAAGCATATCG
TCGTTGCCCTGAAGTTCGGGAGTGACGACATAATCAAGGAGCAGTCGACG
CGCATGCTGTGCACCTTCCTGAAGGCTCCGGCGCTCAAGTACTTGGTACA
CCCGTACGTTAGGAAGGTCATCGAGATCTTGCCGCTTAAGACGCTACTCC
TTCTCCTGGGAGACATGGAGTTCGACATACGCCTAGACGCCTTGGCGTTA
CTGGGAAGGCTGGCCCAGTTCAACCCCGCCTACCTGTTGGCCCCCCTGAG
CAACGTGCTCAAGCATATCGTCGTTGCCCTGAAGTTCGGGAGTGACGACA
TAATCAAGGAGCAGTCGACGCGCATGCTGTGCACCTTCCTGAAGGCTCCG
GCGCTCAAGTACTTGGTACACCCGTACGTTAGGAAGGTCATCGAGATCTT
GCCGCTTAAGGGGGACCCGCGGCTGGCAACGGCAGCCCTGGAGGCCCTAG
GGTGGCTGAGCCTGAGCGCGTCGGAGCTGATGCTGCCGTTCATGGACAAG
CTCATCCCCTTCATGATCACCAGCATACAGGACTCTACCAACGTCAACGG
TCGAGAGGGGGACCCGCGGCTGGCAACGGCAGCCCTGGAGGCCCTAGGGT
GGCTGAGCCTGAGCGCGTCGGAGCTGATGCTGCCGTTCATGGACAAGCTC
ATCCCCTTCATGATCACCAGCATACAGGACTCTACCAACGTCAACGGTCG
AGAGGTCAGCCTCCGCACGCTCGGGCGCATCGTGAGCGCCACCGGCTACG
TGATCAAGCCCTACCTCCGCTACCCTACCCTCCTGGACAGCGCCTTCTCC
ATCCTCCGGGCGGGGGGCAACACGCCCTGGTCCCTCCGCTGCGAGGTGCT
CCGGACCCTGGGCATCCTAGGGGCTCTGGACCCGTACCGTTACGGGCAGA
TCTTGCTCTACCTTCGGGCGCAACGGCTGCAGGCGGAGGCTGTGGCGGCG
GGGGCGAGTACGAGCAGGGGGGACATAAGCCCGTCAGGTCAGCCTCCGCA
CGCTCGGGCGCATCGTGAGCGCCACCGGCTACGTGATCAAGCCCTACCTC
CGCTACCCTACCCTCCTGGACAGCGCCTTCTCCATCCTCCGGGCGGGGGG
CAACACGCCCTGGTCCCTCCGCTGCGAGGTGCTCCGGACCCTGGGCATCC
TAGGGGCTCTGGACCCGTACCGTTACGGGCAGATCTTGCTCTACCTTCGG
GCGCAACGGCTGCAGGCGGAGGCTGTGGCGGCGGGGGCGAGTACGAGCAG
GGGGGACATAAGCCCGTCAGCTAGTGGCAATGCCGCCGGAGGAGACGGAG
ATGGTCTCGCCGCCGCAGCCGCCGCCAGGCATAGAGGAAAACTAGTGGCA
ATGCCGCCGGAGGAGACGGAGATGGTCTCGCCGCCGCAGCCGCCGCCAGG
CATAGAGGAAAA
back to top