mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1 (mRNA) Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79

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Overview
NamemRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1
Unique NamemRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1
TypemRNA
OrganismDiscosporangium mesarthrocarpum MT17_79 (Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79)
Homology
BLAST of mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1 vs. uniprot
Match: C9K4U6_SACJA (Unconventional myosin n=1 Tax=Saccharina japonica TaxID=88149 RepID=C9K4U6_SACJA)

HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 1.930e-6
Identity = 24/39 (61.54%), Postives = 31/39 (79.49%), Query Frame = 2
Query:  263 GKIEGQKVYIPDKEIAWARATVVRAIGKRRFQVKLDSPK 379
            G IEGQKVY+PD +IAWA ATVV A+G  +F+V +D P+
Sbjct:   17 GMIEGQKVYVPDADIAWAPATVVHALGGSKFEVTVDRPR 55          
BLAST of mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5LE99_9PHAE (Myosin motor domain-containing protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2879 RepID=A0A6H5LE99_9PHAE)

HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 1.930e-6
Identity = 25/47 (53.19%), Postives = 36/47 (76.60%), Query Frame = 2
Query:  263 GKIEGQKVYIPDKEIAWARATVVRAIGKRRFQVKLDSPKARGCVQRR 403
            G IEGQKVY+PD +IAWARATV+  +G  RF+V+++  + RG ++ R
Sbjct:   19 GVIEGQKVYVPDDDIAWARATVMHPLGGSRFEVEVERSQERGGLKPR 65          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 2
Match NameE-valueIdentityDescription
C9K4U6_SACJA1.930e-661.54Unconventional myosin n=1 Tax=Saccharina japonica ... [more]
A0A6H5LE99_9PHAE1.930e-653.19Myosin motor domain-containing protein n=2 Tax=Ect... [more]
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
D-mesarthrocarpus_Contig936contigD-mesarthrocarpus_Contig936:21114..25797 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef902022-09-19
Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79 OGS1.02022-07-08
Properties
Property NameValue
Stop0
Start1
Seed ortholog2880.D7G0D6
Preferred nameMYO19
PFAMsDIL,IQ,Myosin_N,Myosin_head
Model size421
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG koko:K10356,ko:K10357,ko:K22366
Hectar predicted targeting categoryother localisation
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0042759,GO:0042802,GO:0042803,GO:0042886,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043008,GO:0043025,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043197,GO:0043200,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043254,GO:0043269,GO:0043325,GO:0043332,GO:0043434,GO:0043436,GO:0043473,GO:0043531,GO:0043588,GO:0043900,GO:0043902,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044297,GO:0044309,GO:0044380,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044430,GO:0044433,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044448,GO:0044456,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044550,GO:0044703,GO:0044706,GO:0044764,GO:0044837,GO:0044877,GO:0045033,GO:0045111,GO:0045165,GO:0045177,GO:0045179,GO:0045184,GO:0045202,GO:0045335,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045773,GO:0045856,GO:0045921,GO:0045927,GO:0045995,GO:0046148,GO:0046189,GO:0046394,GO:0046530,GO:0046677,GO:0046683,GO:0046847,GO:0046872,GO:0046879,GO:0046903,GO:0046907,GO:0046982,GO:0046983,GO:0047497,GO:0048066,GO:0048193,GO:0048232,GO:0048278,GO:0048306,GO:0048308,GO:0048309,GO:0048311,GO:0048313,GO:0048364,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048438,GO:0048467,GO:0048468,GO:0048469,GO:0048471,GO:0048513,GO:0048515,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048588,GO:0048589,GO:0048592,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048638,GO:0048639,GO:0048646,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048731,GO:0048749,GO:0048764,GO:0048765,GO:0048767,GO:0048768,GO:0048770,GO:0048812,GO:0048813,GO:0048814,GO:0048820,GO:0048827,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048868,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048871,GO:0048878,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050772,GO:0050773,GO:0050775,GO:0050776,GO:0050778,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050808,GO:0050848,GO:0050877,GO:0050878,GO:0050891,GO:0050896,GO:0050900,GO:0050931,GO:0050953,GO:0050982,GO:0051015,GO:0051017,GO:0051020,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051270,GO:0051272,GO:0051279,GO:0051282,GO:0051285,GO:0051286,GO:0051293,GO:0051294,GO:0051301,GO:0051302,GO:0051493,GO:0051494,GO:0051591,GO:0051606,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051643,GO:0051645,GO:0051646,GO:0051647,GO:0051648,GO:0051649,GO:0051650,GO:0051653,GO:0051654,GO:0051656,GO:0051674,GO:0051686,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051875,GO:0051904,GO:0051905,GO:0051924,GO:0051960,GO:0051962,GO:0055037,GO:0055044,GO:0060001,GO:0060002,GO:0060151,GO:0060281,GO:0060282,GO:0060284,GO:0060327,GO:0060328,GO:0060341,GO:0060429,GO:0060560,GO:0060627,GO:0060996,GO:0060997,GO:0061024,GO:0061387,GO:0061458,GO:0061572,GO:0061573,GO:0061640,GO:0061645,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070252,GO:0070382,GO:0070648,GO:0070649,GO:0070650,GO:0070727,GO:0070887,GO:0070938,GO:0071229,GO:0071230,GO:0071310,GO:0071375,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071520,GO:0071563,GO:0071695,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071889,GO:0071944,GO:0071963,GO:0071976,GO:0072330,GO:0072384,GO:0072657,GO:0072659,GO:0072676,GO:0072678,GO:0072697,GO:0080147,GO:0090066,GO:0090140,GO:0090426,GO:0090436,GO:0090558,GO:0090567,GO:0090596,GO:0090626,GO:0090627,GO:0090702,GO:0090726,GO:0097061,GO:0097159,GO:0097204,GO:0097367,GO:0097435,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097518,GO:0097574,GO:0097575,GO:0097708,GO:0097718,GO:0097730,GO:0097731,GO:0097733,GO:0098588,GO:0098630,GO:0098657,GO:0098743,GO:0098773,GO:0098793,GO:0098794,GO:0098805,GO:0098840,GO:0098858,GO:0098862,GO:0098916,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099089,GO:0099111,GO:0099118,GO:0099120,GO:0099173,GO:0099402,GO:0099503,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099515,GO:0099518,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099568,GO:0099640,GO:0099738,GO:0106027,GO:0110009,GO:0110053,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0120104,GO:0120117,GO:0140027,GO:0140029,GO:0140056,GO:0150034,GO:1900006,GO:1900076,GO:1900078,GO:1901019,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901981,GO:1902407,GO:1902410,GO:1902531,GO:1902716,GO:1902850,GO:1902875,GO:1902877,GO:1902903,GO:1902904,GO:1902936,GO:1903047,GO:1903076,GO:1903078,GO:1903119,GO:1903169,GO:1903260,GO:1903429,GO:1903431,GO:1903475,GO:1903478,GO:1903479,GO:1903530,GO:1903532,GO:1903541,GO:1903543,GO:1903827,GO:1903829,GO:1904062,GO:1904375,GO:1904377,GO:1904580,GO:1904582,GO:1904601,GO:1904752,GO:1904754,GO:1905392,GO:1905429,GO:1905430,GO:1905475,GO:1905477,GO:1905879,GO:1905881,GO:1990151,GO:1990753,GO:1990778,GO:1990819,GO:1990896,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000145,GO:2000147,GO:2000241,GO:2000243,GO:2000689,GO:2000769,GO:2001257
Exons2
Evalue0.000115
EggNOG OGsCOG5022@1|root,KOG2502@1|root,KOG0160@2759|Eukaryota,KOG2502@2759|Eukaryota
Descriptionphosphatidylinositol binding
Cds size204
COG categoryS
BRITEko00000,ko01009,ko03019,ko03029,ko03036,ko04131,ko04147,ko04812
Relationships

The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1680791089.9932475-UTR-D-mesarthrocarpus_Contig936:21113..213301680791089.9932475-UTR-D-mesarthrocarpus_Contig936:21113..21330Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79UTRD-mesarthrocarpus_Contig936 21114..21330 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1680791090.0100462-CDS-D-mesarthrocarpus_Contig936:21330..213961680791090.0100462-CDS-D-mesarthrocarpus_Contig936:21330..21396Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79CDSD-mesarthrocarpus_Contig936 21331..21396 +
1680791090.0253425-CDS-D-mesarthrocarpus_Contig936:25659..257971680791090.0253425-CDS-D-mesarthrocarpus_Contig936:25659..25797Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79CDSD-mesarthrocarpus_Contig936 25660..25797 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1prot_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79polypeptideD-mesarthrocarpus_Contig936 21331..25797 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1

>prot_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1 ID=prot_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1|Name=mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1|organism=Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79|type=polypeptide|length=68bp
MSVAGLRSGKDGQDLGKIEGQKVYIPDKEIAWARATVVRAIGKRRFQVKL
DSPKARGCVQRRRSTAGG
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mRNA from alignment at D-mesarthrocarpus_Contig936:21114..25797+

Legend: UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1 ID=mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1|Name=mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1|organism=Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79|type=mRNA|length=4684bp|location=Sequence derived from alignment at D-mesarthrocarpus_Contig936:21114..25797+ (Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79)
GGAAAAAATATTGTCCTTCAATCCTTACATTTAGAAACTGAGAAGAGTGT CTAGAGACACTAGAGGAGGGACTTGCGGGAAAACCCAACCCTATTCAGAG GAGGTGCAGGAGGATTGGCCTGCGCCTGGGGTTGCCACAGGGAGGGGGAC TCGAAACGTGGGAAGAAGTGGAGTCTCGGTTGAAGGTCAGGGCAACAGGA AGCCCGCTGCGCGTCGCATGTCCGTCGCTGGCCTGAGGAGTGGAAAGGAT GGGCAAGATCTCGGGAAGATTGAGGGGCAGAAGGTGGGGGATGGGCCAAG AAGAGCTCAACGTTTCCTCGTTCACTGCCTTGCTGGCGGCCTGGCTTTCT GGGCGCCTCCGGTTGCCCAGTTTGGTAGGGAGAGTTGACCTGCAAGAGAA CGGTAGGACCGTCCAACCGCAAAACTTAGCTGCGGTTGGCGTCGATTATC GTGACGTGCCGTTTCTTGGAGTCTCTCTGCTACTATTCTCCGCCCGCTGG TCTTCACATGCCCGCACCTGGTAATGGGGGAGTCGCTTGCTGCAACACAA TGCGATAGTTTTCCTGACCATGCCATACGAAGGAACTAATTTTACGCGTC CTGTGGAGGCAGTACCGAGCCCTCGTCGCCCTTGCAAACCGATTGTATGC ATCACTTTTCATGAGGCGTCGTGCCTATCAGTGAACAGGTGTCCCCGTAT GAATACCGCGGCTCTACCGACCCTTGTCAGTTTCGCCCACATATGTAAAT TCTCTCGAACATGTCTGTGGTCCAGGGGGATAGCTTAATTCGTTGTGGTC CGATCTCCCCCACCCCCCTGTGCGCGCGCCTTACGCGGCCCATGCTACCT CACGAACGCCTGTTGTTATCGGTGCGTCAAGTTTCCTAGGCCGTCTCGAA AAGTACTTGCATATCGGCGGATTACCTTGTTGCCGTAGAGGAACCCGCAT TAGCTGTCCTCGCCCCTTCCCTGGAAGCACATATTCCATCGTCATGGCCC GCCTCGTCTGAAACCGGTTAGGCTTAAGCTACAGCGACTACTCCATGATT GGGACCCTTGGAACGCTCGGGGGTGTTGAGTTGGTTACAGTGGGGTATGG GTTCGGGTCGGCATATTAATCGACTCGAAAAGTTCGCTAATCTAGAAACC TTGCTTAATTTTATGAAGGACCTTGCTGCTAGCACCCCTCACCCCCCCCT TCTAGTCGTGTCTTACAGCTGTATCGAGGTCTCGATCGAATTCTCTGTGC ACGATCACCGTGGCTGGGAAGGGGTTACATGCTCACCTGTGCATCGTGCA TGCTGCCCGTATATTTTAATCGAGCTCATTCGGAAGCTATGATGGGAACC CTCCACCTATCTCATTCAAAATTCGAAATTAACTCCTGCTGAGCCCTTAG CACATGCATGGTCATGCATGTGCTGATGTTCCGCGATTTTCCTATCGAAG TCGAGATCGCCGTGAGCAGTACAGGCTCAGCAGCGTGGTTAGACCGCGTC AGGGTTTTGGGCTAGTATTGGTGCTGCATATCCATTTAATTGTGGTCTAT TTCCCAGACCCATTTTTCCAAGATAATTTTTCCGCCCGATTGACAACTCC CCCTGCACCCATGGGGCGGTGGTTTGGGGTGCCTCAACACAGTGTTTGTC TTCCGACAGCCACTGTTGTTTTAGCGCTGCTGTGTTCGTGGAACGACGCC CCTGATGCCAGGGGACGGTCGGTTGTCTTTGCTCTTGTTGTGGCCAGATG GCAGGCAGCCAATATCTTGACGACTTGACTTATTTCTTGAGGTTGGTTAG GGTTAAAGGGGATGCCTTTTTCCTTGGCTCTGGCTCTGGGATTAATTAAG GAGATAAGAGTCAGGGTTAAGGTTGGGGGTACCTTTGAGGTGCAACCGCA ATGTACACGTAGCATATATCCAGGTATTGCTGCCCTGGAACAAGGGCCTC ATGATCTGGACCGTGAGCTTATGGCGAGGGTGTTCCCTGTGAGCAGATCA CAGAATCGATGGCGATCCATTGCCCCTCCTTTTTTTCCACCCCCATGTCC AGCGGAGTTGGCCTCATGGACCTGTACTACTTTACTGCGGCAAGGTGTGC TAACTGACCCTAACACTAACCCTAAGCCACATGCCTATATTCTAGTGTTA AGATGTTGTACTGTAAGAGGTTGCAAGGGATTGATCTGCTCACAGATAGT GCTGTGCAATAAACAGATGATGTAGAATCTCCTCTAAAAAATAATTGTAG CATGCAGTGGTACAAAAAGGGGTATTAAGAAGAAAAACAATATTTGCGGT AGGGTATGGAATCCTGCACCATCTCTTTTCATTTATGGTGACACCTGGTG ACTGCTGTTTATTCATTTACTGAATTTGAGACAAAAAACAGAAAAAAAAG AAAGAGAACCCCTGTGCCAGCCGAAACCAAGGAGGGTTTTTCTTCTCTTT CTCTTTTTTCCCTTGGTTACAGGGATGTTCATGCTGTGGGCAGCAGACAA AGAAAAGAAGGGAAAAGCAAAAGAAACCTCACGATAGCAGGGGTTAAGTG TTAGGGTTACACGGGTTGAGGGGTTACGGGTCAAGGGTTCAGGGTTTGGG GTTAGTTGCCCTGGTCGGCCGATGCCCATCAACAAGCGGTGGCGCTAGGG TCAATGGTCAAGAGAGGATGGAGGACATCCGTTGATGGGTGATGTCACTG TCAATGGAAGATGTCAGTAGGAGGCGGATGATGTCGGTAGGATGCGTTTT CGATTCGGGCATACACGAAGCCGGTTGAAATGGAAAAAAAAAGAGCATCA GGCGGGGATACTACCCCATGGAGTGCATGACTGAAGGGAGTAAGCATGCG TAAGAGCCAGCACATGCCTGGTATTAAGTAACCCACGGAGGGAAAACTTG ACGCCGCCCTTCCTTTGCCCCTGCTGTGTATATATTATCAGCTCTTTGTC GATAATTGTGCTTCGGAGAGTCCAACAAATACCTGTAACAAAGGCACTGG GTTTAACCTATGAAGCTCATCAGAATTAATTATTTTGTTTGCCTGCAGAA TTTTCTTGCGGAACAAATCCCCAAGTAGCCTTTATCCCTAACCCTAACTG CAACCATCCACTTCGAGGCATTGAATTTTTTATTCTTTTCCTTTCTCCCT TGCTAGGGGGCAATCTATAGTACATGTTCACTGCAGATATCACCCTATAT ACCCTTCACTGGGAAGACGTGTTCTTGGTGCTGCTCTGGTTCCAGGGAGG GAACTTTCAAGGAGGACAAGGAAAAACCATAACGTTACTATCGTTGCTAC TATTACTATTATTATCGTTACTGCTGTTATTATTACTATGTATTATTACT GCATCTACTATTTGTTGTCAGTAGCACTCTATTATTGCTCCTATTATTAA TAGTGTTATTGTTGCTGTGGATATTACTGTTGTGGGGACGAGTCTGGGGA CATGGCCCGCTTCTGGATGACAGTAGCCAATCACTCGGATTGAGAGTAGT ATCAGGAACCGGTATGAGGGGGGGCACCAGAGCTCTCTTATTAAGGGTTA GGGTTGTTTAGGGTTAGGGAAAGCTTGCCCCAGATGCTGGCACATGAAGT GCGCATTCCGTGTTTGGCTTGGTGCTTGGATGTTTAACGCTTAGGCACCC CCTTCCTTTCTCGCAGCACCTTGTGGCTGGAAGAATACGCTTGGTGTTTG TTGGTGATGGTTATTTTTAAGGGTTAAGGGTCTTGTCTTCCTGCTGACTG CTGCCTGTGTGTTACATTTGCTCGCTTACCCGTGGCAACCTCGACCCAAG TCAGCAAGGGATAGCTTTGATCCTAACCCAAACTGGAACCCAAACCCTGA GAGCACAAGTGTACAATATGCCAAGCTATATACAAGGTTGCCAAGCTCTT GTTTACACTTCATGGCATTCATGGGCTACTAATCAAAGAGGAGGTGACAC CACTTCTTCCTCCTATGCGATACTCTGATGTCTGGCAGGTGTTTTGGTGT TTGGTTGATGCTTCAGTAGTCATCCTCAGCGTGGTCAATGCTAACCCTAA CCCTAACCCTAGCCCTAGCCCTAGCCCTAGCCCTAGCCCTGCTGCCTTGC ACAAATTACTACAGTGCATAACCATCTGATGTGAAGCAGAGACACCAATG CCTTAACCCTAGCCCTACCCCTAACCTTACTCCCTACGAATGCAGGGATC CCTGACCCTAAGTAGCAACGGAAAGGCCCCCCTCCTGTAGTAACATCAAC CCCGAACCCTAACCTTAGCCACAACCTTAATCCCCTACTTCCCATGATAA GGTCTGTGTAGGGTTAGGGTTGCACAGTTTGTTTTTGCCCTCCTCGGCAT CGAGCTCGAAAATTCTAACCCTAACCCTAACCTTGTCATTGATCCTAATG ATAATGTCTATGTAGGGTTAGGATCATACAAGGGATGTTTTGTCCGTCCC TGACCACAACATTGGACCCTTACCCTAACCCCCACCGTAACCCTAACCCC AACCCTAACCCAACCCTTACCCTAACCCTAATGGTGCTGAAAACAGGTGT ACATCCCCGATAAGGAGATAGCCTGGGCGAGGGCCACGGTGGTTAGGGCC ATAGGCAAGAGGCGCTTCCAGGTCAAGCTAGACTCCCCCAAGGCCAGGGG GTGTGTGCAGAGGAGGAGGTCTACTGCTGGTGGG
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Coding sequence (CDS) from alignment at D-mesarthrocarpus_Contig936:21114..25797+

>mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1 ID=mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1|Name=mRNA_D-mesarthrocarpus_Contig936.5.1|organism=Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79|type=CDS|length=204bp|location=Sequence derived from alignment at D-mesarthrocarpus_Contig936:21114..25797+ (Discosporangium mesarthrocarpum MT17_79)
ATGTCCGTCGCTGGCCTGAGGAGTGGAAAGGATGGGCAAGATCTCGGGAA
GATTGAGGGGCAGAAGGTGTACATCCCCGATAAGGAGATAGCCTGGGCGA
GGGCCACGGTGGTTAGGGCCATAGGCAAGAGGCGCTTCCAGGTCAAGCTA
GACTCCCCCAAGGCCAGGGGGTGTGTGCAGAGGAGGAGGTCTACTGCTGG
TGGG
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